Thomas Renne

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Bioinformatics Experiences Expériences bioinformatiques

Bioinformatics apprentice Apprenti en bioinformatique

PAPPSO - GQE Le Moulon - Université Paris-Saclay/CNRS/INRAE/AgroParisTech

2019 to 2020 - 2 years 2019 à 2020 - 2 ans
Gif-s/-Yvette,
Olivier Langella

Create GUI and add timsTOF Pro data handling into the proteomics software X!TandemPipeline Développement de GUI et prise en charge du timsTOF Pro au sein du logiciel d'analyse protéomique X!TandemPipeline

  • C++ OOP and Qt
  • Développement POO en C++ et Qt
  • Intégration de la quantification dans XTandemPipeline (MassChroQ et MCQR)
  • Ajout de la prise en charge des données brutes du timsTOF Pro

Bioinformatics intern Stagiaire en bioinformatique

Jacquemont's lab - research center of CHU sainte Justine - University of Montreal Laboratoire Jacquemont - Centre de recherche Sainte Justine - Université de Montréal

2019 - 5 months 2019 - 5 mois
Montréal QC,
Guillaume Huguet

Create GUI and add timsTOF Pro data handling into the proteomics software X!TandemPipeline Quantification de l'impact des CNV du chromosome X humain sur l'intelligence générale

  • C++ OOP and Qt
  • Développement et optimisation de scripts R
  • Analyse de l'impact des CNV avec des modèles de régression linéaire
  • Interprétation des variations biologiques entre les sexes

Bioinformatics intern Stagiaire en bioinformatique

Production team - UniprotKb - EBI EMBL Equipe de production - UniprotKb - EBI EMBL

2018 - 4 months 2018 - 4 mois
Hinxton,
Benoit Bely

Create GUI and add timsTOF Pro data handling into the proteomics software X!TandemPipeline Etude d'homogénéité des groupes orthologues au sein de Uniprot

  • C++ OOP and Qt
  • Analyse de la cohérence des noms de gènes en Python et SQL
  • Text-mining et analyse des noms de protéines avec Spark et Scala

Bioinformatics intern Stagiaire en bioinformatique

OMICX OMICX

2017 - 2 months 2017 - 2 mois
Le Petit Quevilly,

Create GUI and add timsTOF Pro data handling into the proteomics software X!TandemPipeline Analyse automatique de publications et saisie de données

  • C++ OOP and Qt
  • Text-mining d’articles scientifiques avec Python
  • Analyse de publications d’outils bioinformatiques pour les ajouter sur le site d’omictools
  • Amélioration d’algorithme d’authentification d’article bioinformatique

Scientific publications Publications scientifiques

Formation Formation