Thomas Renne

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Bioinformatics Experiences Expériences bioinformatiques

Bioinformatics apprentice Apprenti en bioinformatique

PAPPSO - GQE Le Moulon - Université Paris-Saclay/CNRS/INRAE/AgroParisTech

2019 to 2020 - 2 years 2019 à 2020 - 2 ans
Gif-s/-Yvette,

Create GUI and add timsTOF Pro data handling into the proteomics software X!TandemPipeline Développement de GUI et prise en charge du timsTOF Pro au sein du logiciel d'analyse protéomique X!TandemPipeline

  • C++ OOP and Qt
  • Développement POO en C++ et Qt
  • Intégration de la quantification dans XTandemPipeline (MassChroQ et MCQR)
  • Ajout de la prise en charge des données brutes du timsTOF Pro

Bioinformatics intern Stagiaire en bioinformatique

Jacquemont's lab - research center of CHU sainte Justine - University of Montreal Laboratoire Jacquemont - Centre de recherche Sainte Justine - Université de Montréal

2019 - 5 months 2019 - 5 mois
Montréal QC,

Create GUI and add timsTOF Pro data handling into the proteomics software X!TandemPipeline Quantification de l'impact des CNV du chromosome X humain sur l'intelligence générale

  • C++ OOP and Qt
  • Développement et optimisation de scripts R
  • Analyse de l'impact des CNV avec des modèles de régression linéaire
  • Interprétation des variations biologiques entre les sexes

Bioinformatics intern Stagiaire en bioinformatique

Production team - UniprotKb - EBI EMBL Equipe de production - UniprotKb - EBI EMBL

2018 - 4 months 2018 - 4 mois
Hinxton,

Create GUI and add timsTOF Pro data handling into the proteomics software X!TandemPipeline Etude d'homogénéité des groupes orthologues au sein de Uniprot

  • C++ OOP and Qt
  • Analyse de la cohérence des noms de gènes en Python et SQL
  • Text-mining et analyse des noms de protéines avec Spark et Scala

Bioinformatics intern Stagiaire en bioinformatique

OMICX OMICX

2017 - 2 months 2017 - 2 mois
Le Petit Quevilly,

Create GUI and add timsTOF Pro data handling into the proteomics software X!TandemPipeline Analyse automatique de publications et saisie de données

  • C++ OOP and Qt
  • Text-mining d’articles scientifiques avec Python
  • Analyse de publications d’outils bioinformatiques pour les ajouter sur le site d’omictools
  • Amélioration d’algorithme d’authentification d’article bioinformatique

Scientific publications Publications scientifiques

Formation Formation